يقع قطاع شؤون سلامة الطيران  تنظيميا تحت اشراف  المدير العام. تم تعيين المدير العام المساعد لشؤون سلامة الطيران لإدارة قطاع سلامة الطيران  و الذي يتكون من الادارات التالية:
الملاحة الجوية و المطارات و الجدارة الجوية و عمليات الطيران و الترخيص و ادارة السياسات و الأنظمة و التخطيط.
تم تأسيس قطاع شؤون سلامة الطيران ليضم جميع النشاطات المتعلقة بسلامة الطيران تحت مظلة و احدة. و يعتبر القطاع مسؤول عن التنظيم و الاشراف على سلامة الطيران في دولة الامارات العربية المتحدة.

رسالة القطاع
تنظيم (الاطار التشريعي و السياسات و الأنظمة و المعايير) و الاشراف على السلامة عن طريق (ترخيص و تفتيش و تخويل و تصديق و التدقيق على) صناعة الطيران في دولة الامارات العربية المتحدة لخدمة الجمهور و صناعة الطيران في الدولة بالتجاوب مع متطلبات صناعة الطيران و توفير التكاليف على هذا القطاع .

نبذة تاريخية
في عام 1996 كانت ادارة سلامة الطيران مسؤولة عن التنظيم و الاشراف في المجالات التالية فقط (عمليات الطيران و الجدارة الجوية و ترخيص الطيران). و حيث أن ايكاو اتخذت قرارا بتوسيع نطاق تدقيقها الدولي  على السلامة  ليشمل جميع مرفقات السلامة لمعاهدة شيكاغو. فقد قامت الهيئة العامة للطيران المدني بالمباشرة في برنامج إعادة الهيكلة لاستيفاء المتطلبات من ايكاو و احتياجات صناعة الطيران في دولة الامارات العربية المتحدة.
أدت مخرجات اعادة الهيكلة إلى تواؤم نشاطات  السلامة مع  ملحقات السلامة (1-8، 10-16، 19) التابعة لاتفاقية شيكاغو  تحت قطاع واحد يسمى قطاع شؤون سلامة الطيران في 2011.
 

الهيكل التنظيمي